Oui, certains microscopes numériques permettent d'observer des cellules et des bactéries, à condition de disposer d'une optique biologique adaptée et, généralement, d'un éclairage par transmission traversant la préparation.

Pour observer des cellules végétales ou animales, un microscope biologique numérique offrant des grossissements optiques adaptés peut convenir. L'observation de nombreuses bactéries nécessite une résolution supérieure, souvent obtenue avec un objectif 100x à immersion et un système optique approprié.

En revanche, les microscopes numériques destinés à l'inspection de circuits imprimés, d'insectes ou de minéraux ne sont pas nécessairement adaptés aux préparations biologiques sur lames. Il faut donc choisir le microscope selon les échantillons à examiner.