Oui, certains microscopes numériques permettent de mesurer des dimensions, des distances, des angles ou des surfaces directement sur les images, à condition de disposer des fonctions logicielles adaptées.

Pour obtenir des mesures fiables, le système doit être étalonné à l'aide d'une référence de dimensions connues, généralement une lame micrométrique ou un étalon approprié. Un nouvel étalonnage peut être nécessaire lorsque le grossissement ou la configuration optique change.

Cette fonction est particulièrement utile pour le contrôle qualité, l'inspection industrielle, l'enseignement technique et la documentation scientifique. Tous les microscopes numériques ne disposent cependant pas de fonctions de mesure intégrées.